Он пережил контузию, голодную смерть и нападение горцев. Но главное испытание для Елисея Кречета только начинается.
Удачливый одиночка, в прошлом — обычный парень из нашего мира, а теперь — казак-пластун и лучший ученик старого воина, Елисей сумел выжить там, где погибли бы другие. Он отбил караван, сдружился с контрразведкой и даже пришелся ко двору казачьему кругу. Его дерзкие изобретения и боевые навыки сделали его ценнейшей целью для врагов.
Но судьба преподносит новый удар: на его попечении оказываются несколько осиротевших детей, и Елисей решает вырастить из них настоящую гвардию разведчиков — новое поколение пластунов.
Однако обучить мальчишек военному делу — лишь половина дела. Вокруг зреет опасный заговор: враги не дремлют, и за его «громовыми стрелами» (минометами) охотятся не только османы, но и британские шпионы. Елисею предстоит не только натаскать свою «малолетнюю команду», но и снова вступить в кровавые схватки, раскрывать интриги и вести свою смертельную игру, где цена ошибки — жизнь его учеников.
От погонь и поисков до жестоких рукопашных схваток — «Школа пластунов» — это история о том, как из беспризорников куют элиту, а из одиночки — вожака, готового идти до конца.
Главный герой, Елисей Кречет, приходит в себя после тяжелого ранения в голову, полученного в бою, когда его караван атаковали горцы-абреки. За ним ухаживает его подопечная Санька и знахарка бабка Радмила. Во время разговора с комендантом крепости, штабс-капитаном Алексеем Захаровичем, Елисей узнает, что нападение было не случайным: горцы искали его самого и его изобретение — легкую мортиру. За этим стоят британцы, которые хотят выкрасть изобретателя.
Оправившись, Елисей продолжает учить первых учеников — близнецов Мишку и Саньку, а также сирот Витьку, Илью и Дарью. Его репутация укрепляется после того, как он в одиночку спасает от нападения абреков караван с рабочими. Позже ему приходится заступиться за своих воспитанников на базаре, и он жестоко наказывает обидчиков. В крепости появляются новые ученики — сыновья погибшего пластуна Ермила (Андрейка и Васятка) и вдовы Лизаветы (Ромка, Гришка, Федька).
Елисей проходит обряд посвящения у казачьего круга на Перуновом капище, где его наставник, старый казак дед Святослав, знакомит его с древними традициями. Во время ритуала на груди Елисея появляется родовой знак — силуэт летящего кречета, что символизирует принятие его богами.
В крепость приезжает статский советник Морозов со своей беременной дочерью Екатериной. Следом за ними появляется загадочный дворянин-журналист господин Ноль. По просьбе Морозова Елисей присматривает за его дочерью. В ходе слежки выясняется, что господин Ноль — шпион, связанный с османами и европейцами. Он пытается похитить Екатерину, чтобы шантажировать ее отца. Елисей и его ученики устраивают засаду и обезвреживают шпиона, но в перестрелке погибает один из мальчиков — Илья, который закрывает собой девушку. Елисей тяжело переживает эту потерю.
Позже выясняется, что Екатерина работала на господина Ноля. Она помогает шпиону и его сообщникам бежать из гауптвахты, но они пытаются ее убить. Елисей и его команда догоняют беглецов в лесу и возвращают их в крепость.
Неожиданно приходит высочайший приказ: школу Елисея признают официальной и ставят на государственное финансирование. Сам Елисей получает потомственное дворянство, а его учеников отправляют на фронт в составе отряда князя Буачидзе. Елисей вынужден проводить своих воспитанников в Тифлис. Там он знакомится с князем и его сыном. Его ребята демонстрируют чудеса выучки, поражая князя и его охрану. Елисей дает ценные советы по ведению войны и завоевывает уважение Буачидзе. Позже он спасает дочь князя, Нино, похищенную купцом Молхнадзе, чем еще больше укрепляет их дружбу.
Вернувшись в крепость, Елисей набирает новую группу учеников. Он начинает строить новый дом и планирует учебный полигон. Вскоре его снова привлекают к делу государственной важности: в регионе появляется большое количество фальшивых серебряных монет. Вместе с контрразведчиком полковником Тимофеевым и чиновником Морозовым Елисей участвует в операции по обнаружению подпольного склада и шпионской сети. Во время этой миссии на него снова совершают покушение, но он убивает нападавших и выходит на след организатора преступной схемы. Книга заканчивается тем, что Елисей получает тяжелое ранение, но успевает обезвредить главного злоумышленника.
