Убийства, убийства и убийства…Обезглавленные тела жертв, не имеющих между собой ничего общего.Работа маньяка? Не похоже…Потому что слишком похоже на деяния монстра-полузверя, превращавшего в кровавый хаос коридоры нью-йоркского Музея естественной истории.Но… монстр мертв. Кто же совершает преступления – теперь?..
**Часть первая, Старые кости**
Полицейский водолаз Сноу в составе отряда, ищущего брикет героина в Протоке Гумбольдта, на дне нащупывает два обезглавленных человеческих скелета. Лейтенант д’Агоста приказывает поднять останки. Судмедэксперт Падельски устанавливает, что первый скелет принадлежит исчезнувшей светской красавице Памеле Вишер, а второй обладает аномальными деформациями костей. Падельски, заметив нечто странное, вызывает главного судмедэксперта Брамбелла и приказывает сохранить все в тайне.
В лабораторию судебной антропологии срочно вызывают Марго Грин, помощника смотрителя Нью-Йоркского музея естественной истории. Брамбелл демонстрирует собравшимся следы зубов на костях с давлением около 1200 фунтов на квадратный дюйм. Приглашают доктора Фрока, знаменитого теоретика эволюции. Марго подтверждает, что следы похожи на зубы млекопитающего. Фрок предполагает ДИСГ, но Брамбелл отвергает версию. Директор музея Мирриам предлагает Фроку возглавить исследование в лаборатории музея, и тот соглашается при условии помощи Марго.
Журналист Билл Смитбек получает анонимную встречу с бродягой Стрелком-Радистом, который проводит его к лидеру подземного сообщества «Шестьсот шестьдесят шестая дорога» Мефисто. Тот сообщает, что под землей орудуют «Морщинники», убивающие и поедающие людей. Сержант Хейворд из транспортной полиции докладывает д’Агосте о серии обезглавленных тел бездомных за последние четыре месяца. Д’Агоста, Хейворд и капитан Уокси спускаются в тоннели и находят отрубленную голову, но на них нападают подземные жители, и они с трудом выбираются наверх.
В лаборатории музея Фрок, Брамбелл и Марго на рентгенограмме аномального скелета обнаруживают четыре металлические шайбы, имплантированные в поясничные позвонки. Брамбелл заявляет, что это след хирургической операции. Вскоре Брамбелла находят с перерезанным горлом. Доктор Кавальери из Балтимора опознает пациента по шайбам - это Грегори Кавакита, биолог-эволюционист, бывший смотритель музея и коллега Фрока. Марго и Фрок потрясены.
**Часть вторая, Cui ci sono dei mostri**
Пендергаст в маскировке бродяги вместе с д’Агостой спускается к Мефисто, который называет убийц «недочеловеками» и «каннибалами» с нижнего уровня «Чердак дьявола». Пендергаст находит бывшего инженера Даймонда, который объясняет, что «Чердак дьявола» - это заброшенные Тоннели Астора, затопленные в 1898 году, с единственным входом через «Бутылочное горлышко».
Марго осматривает сгоревшую лабораторию Кавакиты и находит обугленное растение Liliceae mbwunensis (лилия Мбвуна) со следами прививки, что указывает на эксперименты по генной инженерии. Пендергаст в одиночку спускается в Тоннели Астора, находит Хрустальный павильон - руины подземного вокзала, а в нем хижину из человеческих черепов, около 450 штук, с алтарем. Из темноты появляется одно из существ; Пендергаст ранит его, но теряет из виду.
Происходит массовое нападение на поезд подземки на линии Лексингтон-авеню. Существа убивают семь пассажиров и двух служащих. Выжившая Альберта Муньос в ужасе говорит, «Глаза, как у ящериц... лица, как у дьяволов». На совещании Марго излагает теорию, растение Мбвуна содержит реовирус, вызывающий трансформацию; Кавакита синтезировал наркотик «глазурь», но сам стал жертвой; его клиенты, обезумев, начали охотиться. Хорлокер решает затопить Тоннели Астора, сбросив воду из Резервуара Центрального парка.
Перед сбросом готовится зачистка подземелий от бездомных. Марго, д’Агоста и Пендергаст замечают, что в Резервуаре растут лилии Мбвуна. Марго понимает, Кавакита вывел гибрид, способный расти в пресной воде, высадил его в Резервуаре; сброс воды вынесет семена в океан, и вирус активизируется в соленой воде, вызвав экологическую катастрофу. Пендергаст заявляет, «В нашем распоряжении три часа».
**Часть третья, Хижина из черепов**
Сержант Хейворд с отрядом спускается в тоннели для «зачистки». Кроты атакуют полицейских. В Центре контроля Пендергаст, д'Агоста и Марго убеждают Хорлокера и Уокси, что осушать Резервуар нельзя, но выясняется, что сброс воды уже запущен и необратим. Нужно вручную закрыть заслонки под Резервуаром. Уокси и инженер Даффи спускаются, но обнаруживают, что клапаны сломаны - это диверсия. На них нападают Морщинники. Уокси и Даффи погибают.
Марго убеждает Пендергаста взять ее, принеся три литра раствора витамина D, смертельного для Морщинников. Группа - Пендергаст, д’Агоста, Марго, Смитбек, Мефисто - продолжает спуск. Параллельно водолазы-коммандос во главе с Рахлиным плывут запечатывать нижние выходы. Большинство из них гибнет в бою с Морщинниками.
Группа Пендергаста проникает в Хрустальный павильон. Они видят хижину из черепов, ритуал и множество Морщинников. На троне - доктор Фрок. Фрок раскрывает, что он завершил работу Кавакиты, исцелился от паралича, убил Кавакиту и стал лидером культа. Он планирует осушить Резервуар, чтобы выпустить семена лилий в океан и вызвать «Разрыв Голоцена».
Церемонию прерывает атака Сноу. Мефисто жертвует собой, взрывая мину среди Морщинников, и погибает. Марго использует раствор витамина D, разгоняя нападающих. Заряды взрываются, запечатывая тоннели. Вода из Резервуара поступает, но благодаря запечатыванию выходов уровень останавливается и переливается через край, заливая Большую лужайку, прекращая беспорядки. Марго засасывает в дренажную трубу, но она выживает и выбирается через Протоку Гумбольдта, где ее находят Пендергаст, д’Агоста и Смитбек на катере.
**Часть четвертая и последняя / От авторов**
Движение «Вернем себе наш город» больше не проводило демонстраций. Смитбек написал книгу, но она была отредактирована властями под наблюдением Пендергаста; Марго заставила Смитбека пожертвовать половину гонорара обществу содействия бездомным. Ровно через год после затопления Тоннелей Астора Пендергаст, д’Агоста и Марго встретились за ленчем в рыбном ресторане на Южной улице. Содержание беседы неизвестно, но они вышли с улыбкой. В заключении авторы поясняют, что события и персонажи вымышлены, но подземный Манхэттен реален.