Они думали, что нашли просто заброшенный дом. На самом деле они нашли дверь в прошлое, полное жестоких тайн.
Савелий возвращается в родной дом, чтобы разобраться в хитросплетениях прошлого. Но старые стены хранят не только детские воспоминания, но и тайную лабораторию отца, ведущую в самую бездну кромешного мира. Чтобы узнать правду, ему придется пройти по кровавому следу, который ведет из захолустных подвалов в фешенебельные особняки столицы.
В смертельной игре, где на кону не только его жизнь, сошлись жандармы и революционеры, продажные полицейские и тайные общества. Но в мире, где тени обретают плоть, а магия переплетается с политикой, у Савелия есть козырь, о котором враги даже не догадываются. Однако каждый ответ лишь порождает новые вопросы. И самый главный из них: кто на самом деле стоит за этой грандиозной игрой?
Всё начинается с возвращения в старый дом, где когда-то жил Савелий (Савка) со своей матушкой. Дом, в котором отец-колдун проводил свои эксперименты. Возвращение это не просто ностальгическое — братья (Михаил, он же Мишка, и Савелий) хотят выяснить, что на самом деле случилось с их отцом и какие тайны он оставил после себя.
Вместе с ними их верный друг Метелька. Они натыкаются на недружелюбную соседку, которая считает дом проклятым, и находят подвал с входом в другую лабораторию отца. Самое удивительное — чтобы открыть проход, нужна кровь Громовых. Внутри они обнаруживают целую тайную лабораторию с рунами, банками с «мёртвой водой» и странный артефакт, напоминающий «паука» из предыдущих частей.
Но самое страшное ждёт их дальше. Они находят проход в пещеры на той стороне, где отец ставил опыты над разумными существами, похожими на древних людей. Там же они видят жуткое устройство — каменную стелу с рунами, куда стекала кровь. Мишка, который разбирается в артефактах, догадывается, что это концентратор для получения той самой «мёртвой воды». Там же они находят кости и мумифицированные останки людей — очевидно, семьи мага-камнереза, которого отец заставил работать, а потом бросил умирать.
Вернувшись в город, Савелий и его семья сталкиваются с другой проблемой: их выживают из квартиры соседи-аристократы, которые не хотят терпеть столь странную компанию. Но это мелочи по сравнению с тем, что Савелий узнаёт о новом ухажёре своей сестры Татьяны — целителе Роберте.
Савелий решает проследить за Робертом и попадает в самое сердце петербургского дна — на знаменитую Вяземку. Там он становится свидетелем того, как Роберт встречается с местным криминальным авторитетом по прозвищу Король. Выясняется, что Роберт и Король — часть какой-то тёмной системы, которая похищает одарённых людей. Их используют в подпольных лабораториях, «выкачивая» силу для создания опасного «эликсира номер девять».
Хуже всего то, что Савелий спускается в подвалы Вяземки и находит там камеры с измождёнными девушками. Среди них — княжна Одоецкая, которая пропала несколько месяцев назад, сбежав от нежеланного брака и попав в руки революционеров. В подвале царит ужас: твари с той стороны кишат в тенях, а граница между мирами настолько истончена, что вот-вот прорвётся.
Савелий не может оставить девушек. Он устраивает в подвалах настоящий хаос, вытаскивая на свет божий своих теней. Он убивает Короля и Роберта (последнего — принося в жертву Мора, божеству холода и смерти). Прорыв почти случился, но Савелию удаётся вызволить девушек и доставить их в безопасное место — в госпиталь, где работает целитель Николай Степанович (Николя).
В госпитале Савелий, его сестра Татьяна и сам Николя решают рискнуть и применить найденную «мёртвую воду» для лечения безнадёжного пациента, у которого в мозгу завелась тварь-паразит. Эксперимент удаётся: пациент выживает и приходит в себя. Им оказывается Егор Каравайцев, учитель математики, который как раз должен был начать преподавать в новой гимназии Савелия.
Карп Евстратович, старый друг и жандарм, докладывает, что всех, кто был в списке Короля, нашли мёртвыми. Одни покончили с собой, другие сошли с ума и устроили резню. Вся сеть, которую строил Алхимик, рухнула, но её хозяин так и остался в тени.
Савелий с горечью понимает, что, несмотря на победу, это лишь один бой в долгой войне. А ещё у него теперь есть личная причина ходить в гимназию: его новым учителем математики станет спасённый им Егор Каравайцев. И это открывает новые возможности для поисков тех, кто стоит за всеми этими ужасами.
Книга заканчивается на том, что главные герои, пережив страшные открытия, готовятся к новому этапу: учёбе, скрытой войне и поискам Алхимика. Они стали сильнее, но знают, что впереди их ждёт ещё много опасностей.
